盘谷斩破混沌，开天辟地，创造了世间万物。为了阻止混沌复生，他将混沌封印于天外天，却埋下祸根。数万年后，天地间分化为人、神、妖三界，混沌散逸的邪气孕育了魔界。尽管魔界之民逐渐消除暴戾，仍受其他三界的防备与排挤。魔王蚩尤与神界之女的爱情引发三界震怒，魔界遭受讨伐。蚩尤奋起反抗，几乎使三界陷入灭顶之灾。最终，魔界被驱逐，蚩尤为保护族人力竭而亡，身体化作封印守护不周山，其魂魄也被镇压。 数千年后，人间正值商末周初，战乱不断，生灵涂炭。天外天中的混沌邪气复生，神界面临空前灾难，妖界也为祸人间。玩家作为神界的小弟子，带着追踪混沌邪气的使命来到人界，却发现一切远比想象中复杂：自己与早已消亡的魔族有何关联？三界的灾难如何收场？面对混乱的局面，玩家必须在重重谜团中找到自己的方向，拯救三界于水火之中。
